El cambio climático está provocando la desaparición de poblaciones de mariposas apolo (Parnassius apollo), resistiendo las poblaciones ubicadas a mayor altitud. La extinción que ha ocurrido con otras poblaciones de mariposas apolo, como las ubicadas en las montañas de la Yesa, Valencia, puede llegar a ocurrir en Puebla de San Miguel cuando las altitudes en las que sobreviven no satisfagan sus requerimientos o los de sus plantas nutricias.

Desde el parque natural se realiza un seguimiento de la especie desde 2011, mediante transectos en los que se anota el número de mariposas y de sus plantas de libación. Se ha observado un desplazamiento de las poblaciones hacia lugares de más altitud. Este año además se han capturado mariposas hembra para la obtención de huevos fecundados con el objetivo de fortalecer poblaciones. Desde el pasado año también se está llevando a cabo un proyecto de gestión de plantas nectaríferas para la mejora del hábitat de la mariposa apolo, experimentando la remoción del suelo, el enriquecimiento en nutrientes y la siembra de semillas de Carduus assoi.